米开朗琪罗又想逃亡了。
“他想隐遁到杰内附近的一所修道院中去，那里的阿莱里亚主教是他的朋友，也是尤利乌斯二世的朋友。他或能在那边方便地做完他的作品。他亦想起避到乌尔比诺地方，那是一个安静的居处，亦是尤利乌斯二世的故乡；他想当地的人或能因怀念尤利乌斯之故而善待他。他已派了一个人去，到那里买一所房子。”
但，正当决定的时候，意志又没有了：他顾虑他的行动的后果，他以永远的幻梦，永远破灭的幻梦来欺骗自己，他妥协了。他重新被人牵系着，继续担负着繁重的工作，直到终局。
一五三五年九月一日，保罗三世的一道敕令，任命他为圣彼得的建筑绘画雕塑总监。自四月起，米开朗琪罗已接受《最后之审判》的工作。自一五三六年四月至一五四一年十一月止，即在维多利亚逗留罗马的时期内，他完全经营着这项事业。即在这件工作的过程中，在一五三九年，老人从台架上坠下，腿部受了重伤，“又是痛楚又是愤怒，他不愿给任何医生诊治”。他瞧不起医生，当他知道他的家族冒昧为他延医的时候，他在信札中表示一种可笑的惶虑。